Un garçon nommé Toru Kokonoe décide, après avoir perdu une personne chère à ses yeux dans un incident terrifiant, de devenir plus fort et s'inscrit dans une école spéciale qui enseigne des compétences de combat qui utilisent un système de partenariat nommé « Duo » où les gens manifestent leurs âmes sous la forme d'armes appelées Blaze. Toru est capable de produire son propre Blaze, mais pour une quelconque raison il se manifeste comme un bouclier à la place d'une arme. En raison de cela, il va vivre avec Yurie Sigtuna, une magnifique jeune fille aux cheveux argentés.

Il y a bien longtemps, les gens vivaient dans la terreur, gouvernés par un horrible démon. Cependant, un héros légendaire vint mettre fin à l'horrible règne de la créature en l'abattant. C'est de là qu'est née l'Académie Rosewood, un endroit censé former les plus grands héros. Cette école d'élite n'accepte que ceux qui ont le plus de potentiel. Arnest Flaming, une jeune fille qui se targue d'avoir les meilleurs résultats de l'académie, est chargée de faire découvrir les lieux à Blade, un nouvel élève qui semble avoir des pouvoirs rivalisant avec les siens.

Itsuka Shido est un jeune lycéen vivant une vie paisible jusqu'à ce qu'une explosion détruise la ville et qu'une jeune fille en armure apparaisse devant lui. Quelques instants après, sa sœur adoptive Kotori, qui est en réalité commandante de l'organisation militaire Ratatoskr, lui apprend que la fille en question est un esprit qui déstabilise l'espace-temps. Le seul moyen d'arrêter cette menace est que Shido utilise son mystérieux pouvoir lui permettant de sceller les pouvoirs d'un esprit dans son corps. Cependant, cette méthode ne fonctionne que si l'esprit l'affectionne et a confiance en lui. Ainsi, l'organisation Ratatoskr va lui proposer sortir avec cet esprit pour gagner sa confiance et son affection.

Dans le passé, l'humanité a subie une catastrophe naturelle nommée l'impact 'Invertia'. Cette catastrophe a détruit le monde entier. Mais grâce à cet événement, l'humanité a acquit une nouvelle capacité nommée 'Genestella'. L'histoire se passe dans la ville Académique sur eau, nommée Rikka. Cette ville, est autrement connue comme 'l'Astérisque', célèbre pour être la plus grande scène du monde pour la guerre des étoiles. Les personnes de la Génération Starpulse appartenant à six académies différentes ont fait leurs voeux avec des fragments de météorite pour se disputer la suprématie de cette ville. Amagiri Ayato est l'un d'entre eux, après sont arrivée à Rikka grâce à l'invitation du Président de Conseil d'Étudiant de l'Académie Seidoukan, une fille nommée Alexia van Riessfeld Julis, mécontente du fait que ce dernier l'ai vu en sous-vêtements, le défie en duel.

Shûichi Kagaya, un lycéen jusqu'ici sans histoires devient subitement capable de se transformer en un gigantesque "monstre" aux capacités hors normes. Il sauve ainsi la vie de Claire coincée dans une maison en feu. Mais Claire découvre son secret et également qu'elle a la possibilité de se faufiler, par le biais d'une fermeture éclair, dans la mascotte incarnée par Shuîchi. Et si Shuîchi n'était pas le seul dans ce cas !? Qu'est-ce qui attend ces deux lycéens désormais liés par le destin !? Leur plus grand combats est sur le point de commencer !! Ne faisons plus qu'un... à la vie, à la mort !

L'académie Honnōji, un lycée dans lequel règne la peur et la terreur. Celui ci est gouverné par le redoutable conseil des élèves, qui ont la particularité d'utiliser des uniformes Goku. Ces derniers leurs permettent d'être plus fort que n'importe qui, et d'écraser quiconque se dresse sur leur route. Ryūko Matoi est une fille qui transportse avec elle une moitié de ciseaux géant, et recherche le possesseur de l'autre moitié qui s'avère être l'assassin de son père. Dans le but de trouver le meurtrier, Ryūko rentre dans l'académie Honnōji pour y défier Satsuki Kiryūin, la présidente du conseil des élèves...

Au début du XXème siècle, les avancées technologiques permettent aux humains d'insuffler la vie à des objets, en combinant la science et la sorcellerie, puis de les contrôler. De nombreux automates sont ainsi utilisés dans des combats. Akabane Raishin, étudiant à l'Académie Royale des Arts Mécaniques de Walpurgis, accompagné de Yaya, sa marionnette, cherche à devenir le meilleur marionnettiste du monde. L'école organise un tournoi réunissant les cent meilleurs étudiants. Cependant, les notes de Raishin ne sont pas excellente bien qu'il se débrouille magnifiquement bien en combats. De plus, il va devoir lutter contre ses camarades de classe pour atteindre son objectif.

L'histoire nous entraîne dans le quotidien de Masatora Akutsu, un jeune démon venu sur Terre afin de trouver une personne capable de booster le moral de ses troupes et repousser les forces du Paradis. À son arrivée, il fait la rencontre de Lily Amane, une jeune femme qui semble être la personne idéale qu'il recherche. Cependant, il va rapidement apprendre que la belle et gentille Amane est en réalité un ange, son ennemi juré !

Au sein de l'académie japonaise Hagune, les élèves sont répertoriés et classés selon leur aptitude au combats ainsi que leur niveau d'escrime. Kurogane Ikki est un chevalier-mage novice ne jouissant d'aucun talent particulier. Il est en outre l'un des élèves les plus faibles de l'académie bien qu'il soit issu d'un illustre clan dont la réputation n'est plus à faire. Malgré ses mauvaises notes et son faible rang, notre héros n'a jamais renoncé à ses rêves et espère bien un jour siéger sur la plus haute marche du podium des chevaliers-mages. La vie d'Ikki bascule du tout ou tout lorsqu'il est affecté au même dortoir que Stella Vermillon, une princesse dirigeant un modeste royaume situé en Europe. Belle, talentueuse et sérieuse, Stella est tout le contraire d'Ikki : elle est née avec un talent inné et nul ne peut l'égaler au combats. Qui plus est, elle est classée dans les meilleurs élèves de l'académie. En la personne de Stella, notre héros trouvera tout d'abord une rivale mais également une alliée, une partenaire de choc qui visiblement le poussera à se surpasser au plus haut niveau. Déterminés à remporter le tournoi réunissant les sept académies de magie les plus prestigieuses du pays, Ikki et Stella vont dès lors s'entrainer rigoureusement afin d'être sélectionnés. Seront-ils en mesure d'atteindre leur objectif ?

Tsukuné Aono, élève moyen, rate tous ses examens au concours d'entrée de son lycée le plus proche. Sa dernière possibilité est le lycée Yokkai. Il arrive donc complètement perdu dans un lycée où tous les élèves sont des monstres sous leurs formes humaines. Tsukuné se lie très vite d'amitié avec la belle vampire Moka Akashiya qui profite souvent de lui pour lui voler un peu de sang. Un peu plus tard, Tsukuné se rend compte que les humains sont interdits dans le lycée, c'est précisément à ce moment que les ennuis commencent. Au fur et à mesure de l'histoire, Tsukuné et Moka se lieront d'amitié avec d'autres monstres comme Kurumu Kurono la succube, Ginei Morioka le loup-garou ou Yukari Sendo la sorcière.