L'histoire suit sept Masters s'affrontant dans la ville de Fuyuki. Dotés de pouvoirs magiques, et pouvant compter sur l'aide de Servants qu'ils ont invoqués, le dernier d'entre eux pourra s'approprier le Graal et exaucer son vœu le plus cher.

L'histoire se déroule au Japon mille ans après notre ère. Cinq enfants, Saki, Satoru, Maria, Mamoru, et Shun sont nés et ont grandi dans une petite ville tranquille qui peut être décrite comme une utopie. Le monde est gouverné par des gens qui ont la puissance des dieux. Après un certain incident, Saki et les autres réalisent la vraie nature de leur monde. Les cinq enfants se lancent dans une aventure dangereuse pour protéger leurs amis et tout un monde qui est sur le point de s'effondrer.

L'histoire principale se focalise sur une jeune lycéenne de 17 ans : Kasuga Tamaki. Après le départ de ses parents à l'étranger, Tamaki se rend alors dans le village de sa grand-mère pour lui rendre visite. Arrivée au village, pendant que Tamaki se rendait en forêt, elle rencontre soudainement de mystérieuses créatures appelées les Dieux, la jeune fille terrifiée prend la fuite mais un mystérieux garçon apparait pour venir l'aider. Ce jeune homme appelé Onizaki Takuma est un membre des 5 gardiens de la Tamayori hime. Ces 5 gardiens possédant des pouvoirs surnaturels de différents éléments ont pour mission de protéger la jeune fille qui sera la prochaine Tamayori hime, Tamaki a alors pour objectif de protéger une épée nommée Onikimaru.

Dans son enfance, Kotoko a été enlevée par des yokai afin de devenir leur déesse de la sagesse. Depuis, elle sert d'intermédiaire entre le monde des humains et celui des esprits. Mais tout se complique lorsqu'elle tombe amoureuse de Kuro, un jeune homme sortant d'une rupture, qui semble également cacher quelque chose...

Une jeune fille de 15 ans, Kagome, est propulsée à l'époque Sengoku via le vieux puits du temple où elle habite avec sa famille. Elle rencontre Inuyasha, un demi-démon empalé sur un arbre. Ce dernier fut emprisonné d'un sort au moyen d'une flèche tirée en plein cœur par une miko nommée Kikyo. Kagome, la réincarnation de Kikyo, possède en elle la Shikon No Tama, une perle très convoitée qui permet d'accroître les pouvoirs du détenteur de celle-ci. Pour échapper à un démon attiré par la Shikon No Tama, elle délivre Inuyasha qui, une fois avoir tué le démon, exige à son tour la perle. A la suite de péripéties, la Shikon No Tama se brise en une multitude de morceaux. Inuyasha et Kagome se voient alors contraint de s'unir afin de récupérer les fragments dispersés dans le Japon médiéval, ne se doutant pas des nombreux périples qui les attendent...

Akatsuki Iride est une personne très populaire dans la communauté du jeux vidéo. Un jour, il débloque un contenu caché dans un mystérieux jeu gratuit appelé 'Nakanohito Genome' et découvre qu'il s'agit d'un jeu vidéo dans la vraie vie. Peu de temps après, il se réveille et se rend compte qu'il a été kidnappé et amené dans un endroit étrange en compagnie d'autres personnes. Chacune de ces personnes sont spécialisées dans différents genres de jeux. Une étrange personne à tête de lama les rassemble après le premier niveau pour leur expliquer comment le jeu va fonctionner. Ainsi, ils vont découvrir qu'ils ont atterri dans un survival game où ils vont devoir mettre leur vie en jeu pour pouvoir survivre. Vont-ils réussir à terminer ce jeu et retrouver leur liberté ?

L'histoire se déroule dans un monde divisé entre humains et katawara. Tama, une jeune katawara, aime les humains et souhaite les protéger en dépit de leurs différences. Elle est en cela le parfait opposé de son frère, Jinka, avec lequel elle voyage. Peu après avoir rencontré Shinsuke, un guerrier qui souhaite devenir plus fort, le groupe découvre un complot qui a pour objectif de changer les humains en monstres ! Mais Tama n'a pas l'intention de rester les bras croisés.

Koyomi Araragi, un lycéen de troisième année, réussit à réchapper d'une attaque de vampire avec l'aide de Meme Oshino, un homme étrange résidant dans une construction abandonnée. Quoiqu'étant sauvé du vampirisme et maintenant un homme nouveau, plusieurs effets secondaires comme des capacités de guérison surhumaines et la vision améliorée reste toujours. Quand même, Araragi essaye de vivre la vie d'un étudiant normal, avec l'aide de la déléguée de classe, Tsubasa Hanekawa.

Un jeune lycéen, Yuuji Sakai, voit le monde se figer autour de lui alors qu'il rentrait tranquillement de l'école. Apparaissent alors 2 monstres dévorant les gens, comme suspendus dans le temps, autour de Yuuji. Alors que le monstre s'intéresse à cet humain qui peut encore se déplacer, une jeune fille à l'aura de feu, une Flame haze, apparaît et tranche la Rinne, ainsi que Yuuji. Celui-ci découvre alors qu'il est déjà décédé et a été remplacé par une torche, une âme temporaire de substitution. L'amie qui l'accompagnait, Hirai, se révèle avoir été remplacée par une torche à la fin de ce combats. Celle-ci sombre peu à peu dans l'oubli collectif puis disparaît au bout de quelques jours, Shana ayant assisté à son évaporation récupéra un peu de sa flamme et prit sa place dans le monde des humains, depuis ses camarades de classe l'appelent Hirai sans avoir remarqué quelque différence avec la précédente Hirai. Paradoxalement, l'existence de Yuuji persiste. Shana, la Flame haze, doit alors veiller sur lui malgré son ennui car il s'agit d'un Mistes, renfermant un pouvoir puissant, un hougu du nom de Reiji Maigo, lui permettant de rallumer sa torche toutes les 24 heures, à minuit. De ce fait, son intégration à la classe de Yuuji l'aide fortement à être à ses côtés en permanence, elle se révèle également très intelligente et terrorise certains de ses professeurs. Yuuji, désormais certain de ne plus disparaître, décide de l'aider activement dans sa lutte contre les Tomogara no Guze, seigneurs d'un monde parallèle dont une partie utilise la force vitale des humains pour gagner en pouvoir.

Ookami to Koushinryou relate les aventures de Lawrence Craft, un marchand ambulant, qui rêve depuis sept ans qu'il circule sur les routes, d'ouvrir un jour sa propre boutique. De passage à Pasroe, une ville où il fait quelques affaires, il tombe en plein festival de la moisson. Cette fête rend hommage à une louve, la divinité des moissons, qui permet aux paysans d'avoir de bonnes récoltes. Mais les temps changent, l'agriculture évolue et les champs n'ont plus vraiment besoin de la divine Horo. Elle décide donc de repartir chez elle, dans les forêts du Nord. Horo réussira-t-elle à rejoindre sa terre natale ? Lawrence réalisera-t-il son rêve ? Les chemins de la louve et du marchand vont se croiser dans une époque médiévale, pleine de conspirations, tricheries et trahisons.